Contributions to the reuse and reproducibility of computational biology models
Henkel, Ron
1982-
VerfasserIn
aut
Sandkuhl, Kurt
1963-
AkademischeR BetreuerIn
dgs
Snoep, Jacky L.
AkademischeR BetreuerIn
dgs
Universität Rostock
Grad-verleihende Institution
dgg
Universität Rostock
Fakultät für Informatik und Elektrotechnik
Grad-verleihende Institution
dgg
text
theses
Text
Hochschulschrift
gw
2022
monographic
XA-DE
Rostock
Universität Rostock
publisher
November 12, 2022
Rostock
Universitätsbibliothek Rostock
distributor
eng
ger
application/pdf
1 Online-Ressource (xi, 200 Seiten) Illustrationen
Diese Arbeit befasst sich mit der Reproduzierbarkeit und Wiederverwendbarkeit von systembiologischen Modellen, wobei die FAIR-Prinzipien (findable, accessible, interoperable, reusable) im Vordergrund stehen. Sie konzentriert sich auf 5 zentrale Forschungsfragen: Schaffung einer Grundlage für die Modellverwaltung, Auffinden heterogener, halbstrukturierter Modelldaten, Nachverfolgung der Modellentwicklung im Laufe der Zeit, Speicherung von Modellen und ihren Metadaten, Definition der wichtigsten Modellkomponenten für die Ähnlichkeitsanalyse.<ger>
This thesis addresses systems biology model reproducibility and reusability, emphasizing FAIR (findable, accessible, interoperable, reusable) principles. It focuses on 5 core research queries: establishing a baseline for model management, retrieving and ranking heterogeneous, semi-structured model data, tracing model evolution over time, storing models and their metadata, defining crucial model components for similarity analysis.<eng>
Open Access
Urheberrechtsschutz 1.0
vorgelegt von Ron Henkel
GutachterInnen: Kurt Sandkuhl (Universität Rostock, Institut für Informatik) ; Jacky Snoep (Stellenbosch University, Department of Biochemistry)
Dissertation Universität Rostock 2023
004
570
http://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00004411
https://doi.org/10.18453/rosdok_id00004411
https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00004411-3
https://d-nb.info/1301016926/34
Contributions to the reuse and reproducibility of computational biology models
Rostock : Universität Rostock, 2022
Druck-Ausgabe
(DE-627)185803597X
Henkel, Ron, 1982 -
urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00004411-3
10.18453/rosdok_id00004411
1395234912
rda
DE-627
230828
1858034914
20251226T211847.0
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(Revision 1.174 20250328)
ger