Etablierung des E2F1-Interaktoms metastasierungsrelevanter Faktoren durch Integration bioinformatischer und experimenteller Methoden
Marquardt, Stephan
1981-
VerfasserIn
aut
Pützer, Brigitte Maria
1962-
AkademischeR BetreuerIn
dgs
Kaderali, Lars
1974-
AkademischeR BetreuerIn
dgs
Universität Rostock
Grad-verleihende Institution
dgg
Universität Rostock
Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät
Grad-verleihende Institution
dgg
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Hochschulschrift
gw
2019
monographic
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Rostock
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2019
Rostock
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In dieser Arbeit wurde durch intensive Literatur- und Datenbankrecherche ein Protein-Protein/Gen-Interaktionsnetzwerk um den Transkriptionsfaktor E2F1 herum erstellt. Er ist Schlüsselfaktor für die epithelial-mesenchymale Transition (EMT), Voraussetzung für die Metastasierung. Eine anschließende bioinformatische Analyse identifizierte tumorspezifische Signaturen der E2F1-vermittelten EMT, welche experimentell und anhand von Patientendaten validiert wurden. Gemeinsame Zielgene des näher untersuchten E2F1-TGFβ-Interaktoms bieten mögliche Therapieziele für Krebspatienten.<ger>
By intensive literature and database research we constructed a comprehensive map of interactions around the transcription factor E2F1, a key driver of the epithelial-mesenchymal transition (EMT) as a prerequisite for metastasis. The subsequent bioinformatics analysis of this map lead to the identification of tumour-specific molecular signatures of E2F1-driven EMT. These signatures were validated experimentally as well as on patient data. Common transcriptional targets of the investigated E2F1-TGFβ co-regulome might be suitable therapeutic targets for cancer patients.<eng>
vorgelegt von Stephan Marquardt
Für nähere Informationen zur bioinformatischen Analyse des E2F1-Netzwerkes, siehe die parallele Doktorarbeit von Faiz M. Khan: "An integrated workflow to study large-scale biochemical networks" der Fakultät für Informatik und Elektrotechnik der Universität Rostock. Teile beider Doktorarbeiten wurden publiziert unter: "Unraveling a tumor type-specific regulatory core underlying E2F1-mediated epithelial-mesenchymal transition to predict receptor protein signatures" Khan FM, Marquardt S, Gupta SK, Knoll S, Schmitz U, Spitschak A, Engelmann D, Vera J, Wolkenhauer O, Pützer BM. Nat Commun. 2017 Aug 4;8(1):198. doi: 10.1038/s41467-017-00268-2
GutachterInnen: Brigitte M. Pützer (Universitätsmedizin Rostock, Institut für Experimentelle Gentherapie und Tumorforschung) ; Lars Kaderali (Universität Greifswald, Institut für Bioinformatik)
Dissertation Universität Rostock 2020
570
610
616.994
610
WG 1940
42.13
http://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00003004
https://doi.org/10.18453/rosdok_id00003004
https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00003004-4
https://d-nb.info/1293663247/34
Etablierung des E2F1-Interaktoms metastasierungsrelevanter Faktoren durch Integration bioinformatischer und experimenteller Methoden
Rostock, 2019
Druck-Ausgabe
(DE-627)1756648026
Marquardt, Stephan, 1981 -
urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00003004-4
10.18453/rosdok_id00003004
1247468662
rda
DE-627
210426
1755927991
20251226T193200.0
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ger