Massenspektrometrische Präzisionsanalyse eines Antikörper-Bindemotivs in der Linker-Region von C2H2-Zinkfinger-Proteinen: von der Charakterisierung der Epitop-Feinstruktur zur Antikörper-basierten Tumordiagnostik am Beispiel des Endometriumkarzinoms Scherf, Maximilian , 1995- (VerfasserIn) Glocker, Michael , 1960- (AkademischeR BetreuerIn) Reimer, Toralf , 1968- (AkademischeR BetreuerIn) Borchers, C. H. (AkademischeR BetreuerIn) Universität Rostock (Grad-verleihende Institution) Universitätsmedizin Rostock (Grad-verleihende Institution) Text theses Text Hochschulschrift 2023 21.03.2023 ger electronic resourceremoteComputermedienOnline-Ressourceapplication/pdf1 Online-Ressource (V, 94, lxxxvi Seiten) Illustrationen, Diagramme Mittels ITEM-TWO untersuchte ich, inwieweit eine Tumordiagnostik mit dem anti-HpTGEKP-Antikörper von Aminosäureaustauschen/Phosphorylierungen im bipolaren Antikörperbindemotiv abhängig ist. Getestet wurden 15 Peptidsequenzen: Die 10 häufigsten C2H2-Zinkfinger-Linker und der im Endometriumkarzinom im ZNF331-Gen gehäuft vorkommende H11Y-Austausch, inkl. Phosphorylierungen. Dabei führte die präzisere Differenzierung von Antikörperbindungen zur Einteilung in ‚orthodoxe/unorthodoxe‘ Epitop-Paratop-Bindungstypen, was wegweisend zur Charakterisierung künftiger Antikörperdiagnostika/-therapeutika ist.<ger> I applied ITEM-TWO to investigate whether tumor diagnosis with the anti-HpTGEKP antibody depended on amino acid exchanges/phosphorylations within its bipolar binding motif. 15 peptides were tested: The 10 most common C2H2 zinc finger linkers and linkers carrying the H11Y exchange plus phosphorylations, caused by mutation of the ZNF331 gene in uterine corpus endometrial carcinoma. To reach my goal I needed to further differentiate specific antibody binding introducing a novel 'orthodox/unorthodox' binding type, which will improve assessment of future antibody-based diagnostics/therapeutics.<eng> Open Access Namensnennung 4.0 International vorgelegt von Maximilian Scherf Artikel in Fachzeitschriften: 08/2022 (Erstautor): Epitope fine mapping by mass spectrometry: Investigations of immune complexes consisting of monoclonal anti‐HpTGEKP- antibody and zinc finger protein linker phospho‐hexapeptides Scherf M, Danquah BD, Koy C, Lorenz P, Steinbeck F, Neamtu A, Thiesen H-J, Glocker MO ChemBioChem. 2022;23(20). 01/2023 (Erstautor): Characterization of Phosphorylation-Dependent Antibody Binding to Cancer-Mutated Linkers of C2H2 Zinc Finger Proteins by Intact Transition Epitope Mapping-Thermodynamic Weak-Force Order Analysis Scherf M, Koy C, Röwer C, Neamtu A, Glocker MO. J Am Soc Mass Spectrom. 2023;34(2):171-81. Konferenzbeiträge: 06/2022 (Erstautor): Mass Spectrometric Binding Strength Characterization of Paratope - Epitope Interactions with Amino Acid Residue Resolution: Towards Deciphering Molecular “Recognition Codes” Scherf M, Danquah BD, Koy C, Lorenz P, Steinbeck, F Neamtu A, Thiesen H-J, Glocker MO. 70th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics. Minneapolis, Minnesota, USA. 05/2023 (Co-Autor): Mass Spectrometric ITEM-TWO Investigations and Bio- Computational Analyses of Phosphorylation-Dependent Antibody Binding to Cancer-Mutated Linkers of C2H2 Zinc Finger Proteins Koy C, Scherf M, Röwer C, Neamtu A, Glocker MO. 54th Annual Conference of the German Society for Mass Spectrometry. Dortmund, Germany. 08/2023 (Co-Autor): Mass Spectrometric ITEM-TWO Investigations and Bio-Computational Analyses of Phosphorylation-Dependent Antibody Binding to Cancer-Mutated Linkers of C2H2 Zinc Finger Proteins Koy C, Scherf M, Röwer C, Neamtu A, Glocker MO. 16th German Peptide Symposium. Jena, Germany GutachterInnen: Michael O. Glocker (Proteomzentrum Rostock, Abteilung für Proteomforschung, Universitätsmedizin und Naturwissenschaftliche Fakultät, Universität Rostock) ; Toralf Reimer (Gynäkologie, Klinikum Südstadt Rostock) ; Christoph Borchers (Centre for Translational Research in Cancer, McGill University, Lady Davis Institute for Medical Research, Jewish General Hospital, Montréal, Québec, Kanada) Dissertation Universität Rostock 2023 610 616.994 610 35.76 44.03 44.81 44.92 https://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00004466 https://doi.org/10.18453/rosdok_id00004466 https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00004466-9 https://d-nb.info/1311381333/34 Massenspektrometrische Präzisionsanalyse eines Antikörper-Bindemotivs in der Linker-Region von C2H2-Zinkfinger-Proteinen--(DE-627)1870620550 urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00004466-9 doi: 10.18453/rosdok_id00004466 oclc: 1409656286 ppn: (DE-627)1870620542