Development of genomic resources and tools for precision farming of pikeperch through high-throughput sequencing and computational genomics Nguinkal, Julien Alban , 1987- (VerfasserIn) Goldammer, Tom , 1965- (AkademischeR BetreuerIn) Wolkenhauer, Olaf , 1966- (AkademischeR BetreuerIn) Simm, Stefan , 1985- (AkademischeR BetreuerIn) Universität Rostock (Grad-verleihende Institution) Universität Rostock Agrar- und Umweltwissenschaftliche Fakultät (Grad-verleihende Institution) Text theses Text Hochschulschrift 2021 December 2021 eng ger electronic resourceremoteComputermedienOnline-Ressource1 Online-Ressource (xi, 131 Seiten) Illustrationen, Diagramme This thesis provides the first genomic tools and resources to enhance pikeperch's innovative farming, optimal domestication, and adaption into modern intensive aquaculture systems, including a high-quality chromosome-level assembly, reference transcriptome, and gene expression atlas. The pikeperch genome was also used as a reference for comparative genomics analyses and population genetics analyses in domesticated individuals to establish the landscape of genetic variations. These findings lay the foundation for addressing critical issues in genomics-informed pikeperch farming.<eng> Diese Dissertation stellt die ersten genomischen Werkzeuge und Ressourcen zur Verfügung, um die innovative Zanderzucht, optimale Domestizierung und Anpassung an moderne intensive Aquakultursysteme zu verbessern, einschließlich einer hochwertigen Genom-Assemblierung auf Chromosomenebene, eines Referenztranskriptoms und eines Genexpressionsatlasses. Das Genom des Zanders wurde auch als Referenz für vergleichende Genomanalysen und populationsgenetische Analysen bei domestizierten Individuen verwendet, um die Landschaft der genetischen Variationen zu ermitteln.<ger> vorgelegt von Julien A. Nguinkal GutachterInnen: Tom Goldammer (Dept. of Molecular Biology and Genetics of Fish, Faculty of Agricultural and Environmental Sciences, University of Rostock, Germany) ; Olaf Wolkenhauer (Dept. of Systems Biology and Bioinformatics, Faculty of Computer Science and Electrical Engineering, University of Rostock, Germany) ; Stefan Simm (Institute of Bioinformatics, University Medicine Greifswald, University of Greifswald, Germany) Dissertation Universität Rostock 2022 004 570 570 WC 7700 WR 6100 42.81 42.11 48.68 http://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00004127 https://doi.org/10.18453/rosdok_id00004127 https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00004127-0 https://d-nb.info/1293539945/34 Development of genomic resources and tools for precision farming of pikeperch through high-throughput sequencing and computational genomics--(DE-627)183162284X urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00004127-0 doi: 10.18453/rosdok_id00004127 oclc: 1358382932 ppn: (DE-627)1830837869